MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 33140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000854	CCT	2	6	52999	53004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430867
1002	NC_000854	ACT	2	6	53316	53321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600431
1003	NC_000854	TAA	2	6	53328	53333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600431
1004	NC_000854	AGG	2	6	53361	53366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600431
1005	NC_000854	GGCT	2	8	53415	53422	0 %	25 %	50 %	25 %	14600431
1006	NC_000854	G	6	6	53515	53520	0 %	0 %	100 %	0 %	14600431
1007	NC_000854	CGG	2	6	53547	53552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600431
1008	NC_000854	GAG	2	6	53597	53602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600431
1009	NC_000854	AGG	2	6	53606	53611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600431
1010	NC_000854	CCT	2	6	53641	53646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600431
1011	NC_000854	G	6	6	53675	53680	0 %	0 %	100 %	0 %	14600431
1012	NC_000854	AAT	2	6	53734	53739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600431
1013	NC_000854	TTC	2	6	53804	53809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430868
1014	NC_000854	GCT	2	6	53867	53872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430868
1015	NC_000854	CTC	2	6	53884	53889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430868
1016	NC_000854	T	6	6	53927	53932	0 %	100 %	0 %	0 %	118430868
1017	NC_000854	CTT	2	6	53958	53963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430868
1018	NC_000854	GA	3	6	54132	54137	50 %	0 %	50 %	0 %	14600432
1019	NC_000854	AG	3	6	54138	54143	50 %	0 %	50 %	0 %	14600432
1020	NC_000854	G	6	6	54302	54307	0 %	0 %	100 %	0 %	14600432
1021	NC_000854	GTGCTA	2	12	54321	54332	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	14600432
1022	NC_000854	CA	3	6	54351	54356	50 %	0 %	0 %	50 %	14600432
1023	NC_000854	CGC	2	6	54569	54574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430869
1024	NC_000854	TCC	2	6	54584	54589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430869
1025	NC_000854	AG	3	6	54716	54721	50 %	0 %	50 %	0 %	118430869
1026	NC_000854	TAT	2	6	54728	54733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430869
1027	NC_000854	TG	4	8	54754	54761	0 %	50 %	50 %	0 %	118430869
1028	NC_000854	CCT	2	6	54838	54843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430869
1029	NC_000854	CTC	2	6	54845	54850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430869
1030	NC_000854	TCC	2	6	54854	54859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430869
1031	NC_000854	ATT	2	6	54897	54902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430869
1032	NC_000854	CTC	2	6	54921	54926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430869
1033	NC_000854	AGCC	2	8	55019	55026	25 %	0 %	25 %	50 %	118430869
1034	NC_000854	GCC	2	6	55062	55067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430869
1035	NC_000854	ATG	2	6	55074	55079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430869
1036	NC_000854	AGA	2	6	55098	55103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430869
1037	NC_000854	ACA	2	6	55140	55145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430869
1038	NC_000854	CAG	2	6	55186	55191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430869
1039	NC_000854	CTC	2	6	55245	55250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430869
1040	NC_000854	GAC	2	6	55346	55351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430869
1041	NC_000854	AG	3	6	55394	55399	50 %	0 %	50 %	0 %	118430869
1042	NC_000854	AG	3	6	55406	55411	50 %	0 %	50 %	0 %	118430869
1043	NC_000854	GCCC	2	8	55430	55437	0 %	0 %	25 %	75 %	118430869
1044	NC_000854	TC	3	6	55461	55466	0 %	50 %	0 %	50 %	118430869
1045	NC_000854	ATG	2	6	55575	55580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430869
1046	NC_000854	CT	3	6	55620	55625	0 %	50 %	0 %	50 %	118430869
1047	NC_000854	CCA	2	6	55641	55646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430869
1048	NC_000854	ACA	2	6	55663	55668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430869
1049	NC_000854	AGC	2	6	55733	55738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430869
1050	NC_000854	AAC	2	6	55754	55759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430869
1051	NC_000854	CT	3	6	55809	55814	0 %	50 %	0 %	50 %	118430869
1052	NC_000854	TGAA	2	8	55836	55843	50 %	25 %	25 %	0 %	118430869
1053	NC_000854	CTCG	2	8	55889	55896	0 %	25 %	25 %	50 %	118430869
1054	NC_000854	AAG	2	6	55919	55924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430869
1055	NC_000854	CGT	2	6	55943	55948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430869
1056	NC_000854	GT	3	6	55960	55965	0 %	50 %	50 %	0 %	118430869
1057	NC_000854	CAA	2	6	56045	56050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430869
1058	NC_000854	CCT	2	6	56055	56060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430869
1059	NC_000854	CTGGG	2	10	56092	56101	0 %	20 %	60 %	20 %	118430869
1060	NC_000854	AGG	2	6	56178	56183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430869
1061	NC_000854	TAG	2	6	56227	56232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430869
1062	NC_000854	AAT	2	6	56321	56326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430869
1063	NC_000854	CGC	3	9	56374	56382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430869
1064	NC_000854	TCAACT	2	12	56403	56414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430869
1065	NC_000854	CGA	2	6	56416	56421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430869
1066	NC_000854	GTC	2	6	56436	56441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430869
1067	NC_000854	TCC	2	6	56586	56591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430870
1068	NC_000854	CA	3	6	56594	56599	50 %	0 %	0 %	50 %	118430870
1069	NC_000854	ACA	2	6	56610	56615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430870
1070	NC_000854	ATGCTT	2	12	56678	56689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118430870
1071	NC_000854	CTC	2	6	56705	56710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430870
1072	NC_000854	AGC	2	6	56741	56746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430870
1073	NC_000854	AGC	2	6	56792	56797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430870
1074	NC_000854	CCT	2	6	56833	56838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430870
1075	NC_000854	GA	3	6	56844	56849	50 %	0 %	50 %	0 %	118430870
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1080	NC_000854	GCTC	2	8	57162	57169	0 %	25 %	25 %	50 %	118430870
1081	NC_000854	CA	3	6	57170	57175	50 %	0 %	0 %	50 %	118430870
1082	NC_000854	AAT	2	6	57232	57237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430870
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1085	NC_000854	CTG	2	6	57467	57472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430870
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1088	NC_000854	TTC	2	6	57607	57612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430870
1089	NC_000854	AAC	2	6	57755	57760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430870
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1093	NC_000854	GAC	2	6	58069	58074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430871
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1096	NC_000854	AT	3	6	58199	58204	50 %	50 %	0 %	0 %	118430871
1097	NC_000854	AAG	2	6	58249	58254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430871
1098	NC_000854	A	6	6	58297	58302	100 %	0 %	0 %	0 %	118430871
1099	NC_000854	ACT	2	6	58376	58381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430871
1100	NC_000854	GCC	2	6	58427	58432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430871
1101	NC_000854	TCC	2	6	58451	58456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430871
1102	NC_000854	GAC	2	6	58497	58502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430871
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1106	NC_000854	AG	3	6	58624	58629	50 %	0 %	50 %	0 %	118430872
1107	NC_000854	GT	3	6	58801	58806	0 %	50 %	50 %	0 %	118430872
1108	NC_000854	TGAAGT	2	12	58837	58848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430872
1109	NC_000854	GCC	2	6	58896	58901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430872
1110	NC_000854	CTG	2	6	58935	58940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430872
1111	NC_000854	TGGG	2	8	58946	58953	0 %	25 %	75 %	0 %	118430872
1112	NC_000854	CA	3	6	58964	58969	50 %	0 %	0 %	50 %	118430872
1113	NC_000854	CT	3	6	58988	58993	0 %	50 %	0 %	50 %	118430872
1114	NC_000854	CTC	2	6	58997	59002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430872
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1122	NC_000854	CCA	2	6	59583	59588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430873
1123	NC_000854	AT	3	6	59628	59633	50 %	50 %	0 %	0 %	118430873
1124	NC_000854	TTG	2	6	59719	59724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430873
1125	NC_000854	GTT	2	6	60099	60104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600438
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1497	NC_000854	AAG	2	6	80538	80543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430885
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